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Pfu Mix(P2021-P2022)

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P2021(1 ml(40次,50 μl/次)) P2022(1 ml*5(200次,50 μl/次)

Pfu Mix

Cat. #P2021,P2022

產品簡介

Pfu Mix濃縮的PCR擴增預混和溶液,含有Pfu DNA聚合酶、dNTP混合物、緩沖液等PCR擴增必需組分(模板與引物除外)。使用時,僅需在擴增體系中加入模板和引物即可進行PCR,大大簡化操作過程,縮短操作時間,降低污染(加樣次數減少)。同時,由于體系內含有優化劑與增強劑,能夠顯著增強PCR擴增的靈敏度。擴增產物具有平末端。

Pfu DNA聚合酶是極端嗜熱性細菌Pyrococcus furiosus來源的高度熱穩定DNA聚合酶,分子量為90 KD。其保真性是普通Taq DNA聚合酶的10倍左右。擴增片段的長度可達5 kb(簡單模板)。延伸速度為2min/kb70-75℃,簡單模板可達20s/kb)。該酶具有5’→3’聚合酶活性和3’→5’外切酶活性。

產品組成

Component

P2021

P2022

2× Pfu Mix

1 ml

1 ml× 5

超純水

1 ml

1 ml× 5

本產品分含體系中包含溴酚藍、不含溴酚藍兩類。體系中包含溴酚藍的產品,PCR擴增產物可直接電泳檢測。這兩類產品的擴增性能無差異。如無特別說明提供體系中包含溴酚藍的包裝。

保存條件

-20℃保存2年。

質量控制

純度檢測:經質量檢測,產品不含脫氧核糖核酸內切酶、脫氧核糖核酸外切酶和核糖核酸酶污染。

功能檢測:PCR方法檢測無宿主殘余DNA,能有效擴增人基因組中的單拷貝基因。

應用舉例

1. 配制反應體系

請于冰上配置反應體系,體系大小與組分用量與添加順序可調整:

Ordinal

Component

Volume

(50 μl reaction volume)

Final   concentration

(50 μl reaction volume)

1

2× Pfu Mix

25   μl

2

upstream   primer (10 μM)[1]

2 μl

0.4   μM

3

downstream   primer (10 μM)[1]

2 μl

0.4   μM

4

template   DNA[2]

1-4   μl

<1μg

5

超純水[3]

To   50 μl

-

optional

MgCl2(MgSO4)/PCR   Enhancer[4]

Variable

-

[1] 引物終濃度建議范圍:0.1-1 μM。特異性差時可降低濃度,效率低時可提高濃度。

[2] 不同模板最佳用量不同,部分DNA模板建議用量如下表(50 μl反應體系)。

Template

人類基因組DNA

λDNA

大腸桿菌基因組DNA

質粒DNA

Dosage

0.1μg-1μg

0.5ng-5ng

10ng-100ng

0.1ng-10ng

[3] 可單獨訂購超純水(Cat. #P9021/P9022/P9023)。

[4] 可單獨訂購25mM MgCl2Cat. #P9031)和PCR EnhancerCat. #P9041)。

2. 設定反應程序進行PCR反應

Stage  

Temperature

Time

Number   of Cycles

Initial   Denaturation

94℃

3   min

1

Denaturation

94℃

30   sec

25-35  

Annealing

55-68℃[1]

30   sec

Extension

72℃

Variable[2]

Final   Extension

72℃

5-10   min

1

[1] 退火溫度應根據Tm值較低的引物來設。

[2] 延伸時間按2min/kb來設最佳(簡單模板可達20s/kb)。

3. 分析結果

反應產物可直接進行瓊脂糖凝膠電泳,通過凝膠成像設備觀察目的條帶的擴增情況。如有需要,可進行割膠回收。

無產物或產物量少的改進措施有:1調整退火溫度;2減少抑制劑的影響,如提取的基因組DNA中含有抑制擴增的成分,需要高倍稀釋(1: 10000)后使用;3采用乙醇沉降洗脫,提高模板DNA的純度;4使用PCR添加劑,如PCR EnhancerCat. #P9041、MgCl2Cat. #P9031等可提高產量。

操作注意事項

1 室溫下Pfu DNA聚合酶有一定的活性,為避免發生非特異性擴增,請于冰上配置反應體系,并且最后添加Pfu DNA聚合酶或模板DNA。

2 Pfu DNA聚合酶的擴增產物只有平末端,可直接用于平末端連接。如要進行TA克隆,請先進行加A反應,以提高克隆效率。(加A反應:參考如下體系,72℃,15-30min

PCR(純化)產物

1-7   μl

10×   Taq BufferMg2+ Plus

1   μl

dATP  

0.2   mM

Taq   DNA聚合酶

5U

超純水

To   10 μl

堿基出錯率是指在每個堿基合成過程中所摻入的錯誤核苷酸數目。Pfu DNA聚合酶的堿基錯誤率為1×10-6。

4 dUTP、dITP和含有這些核苷酸的引物不能用于Pfu DNA聚合酶催化的PCR擴增。因為該酶與含有尿嘧啶和次黃嘌呤的DNA模板結合后會中止DNA聚合反應。

引物設計注意事項

引物長度一般在15-30個堿基之間;上下游引物3’末端避免互補,避免出現3個以上重復的GC,或出現發夾結構,否則會產生非特異性擴增;GC含量控制在40-60%,且上下游引物GC含量盡量接近;Tm值控制在55-65℃之間,且上下游引物Tm值盡量接近,額外附加序列(酶切位點、修飾等)是非模板匹配序列,不參與Tm值計算。

相關產品

名稱

貨號

規格

PCR Mix

P2011/P2012/P2013/P2014/P2015

1ml/5ml/10ml/50ml/100ml

Power Green qPCR Mix

P2101/P2102/P2103/P2104/P2105

1ml/5ml/10ml/50ml/100ml

1kb ladder

M1181/M1182

50/250

DSTM5000

M1111/M1112

60/300

高純度質粒小提試劑盒

N1011/N1012/N1013

50/100/200

通用RNA提取試劑盒

R1051

50

基因組DNA快速提取試劑盒

N1111/N1112

50/100

DNA凝膠回收試劑盒

N1071/N1072/N1073

50/100/200

RT-PCR Kit

R1011/R1012

20/100

更多PCR酶、DNA Marker及核酸提純類產品請登錄東盛生物官網查詢。

 

 


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